همکاری و هماهنگی قوه قضائیه، ارگان های قضائی کشور، نیروهای انتظامی، نیروی مقاومت بسیج سپاه پاسداران انقلاب اسلامی و کلیه دستگاههای مسئول برخورد با منکرات در کشور و استفاده از اطلاعات آنان جهت احیای امر به معروف و نهی از منکر در جامعه بر اساس اهداف و سیاست های ستاد.

وظایف :
1- برقراری ارتباط با مراکز قضائی، نیروهای انتظامی، نیروی مقاومت بسیج سپاه پاسداران انقلاب اسلامی و تشکیل جلسات، کمسیون ها، گردهمایی ها، سمینارهای مختلف به منظور کسب اطلاعات و هماهنگی های لازم.
2- بررسی علل و شیوه های مقابله و جلوگیری از پیدایش و گسترش منکرات از طریق جمع آوری اطلاعات از مراکز قضائی، نیروهای انتظامی، نیروی مقاومت بسیج سپاه پاسداران انقلاب اسلامی.
3- همکاری در تهیه طرح ها و برنامه های مناسب به منظور احیاء امر به معروف و نهی از منکر در مراکز قضائی و نیروی های مسلح و نیروی مقاومت بسیج سپاه پاسداران انقلاب اسلامی.
4- توجیه مدیریت های مربوط در سراسر کشور جهت اجرای مصوبات دبیرخانه ستاد.
5- ابلاغ خط مشی های ستاد به مدیریت ها و نظارت و پیگیری مصوبات ابلاغ شده به آنان.
6- تهیه گزارش چگونگی اجرا و پیشرفت برنامه ها به طور ماهانه و تقدیم به دبیر.
7- پیشنهاد افراد جهت تصدی مدیریت های تابعه به دبیر ستاد جهت انتصاب.
 
این معاونت دارای یک دفتر و مدیریت های زیر می باشد:
الف) مدیریت حقوقی و قضائی
ب) مدیریت انتظامی
ج) دفتر معاونت
 
وظایف مدیریت های تابعه حوزه سازمانهای اجرایی:
1- بررسی و اظهار نظر در خصوص طرح های ارجاع شده به مدیریت و ارائه نظرات حقوقی، قضائی و انتظامی به معاونت سازمانهای اجرایی ستاد.
2- بررسی چگونگی همکاری و استفاده از امکانات و توانایی های مراکز قضائی ، نیروهای انتظامی، نیروی مقاومت بسیج سپاه پاسداران انقلاب اسلامی در اجراء طرح های مصوب ستاد.
3- جلب مشارکت ، هماهنگی و همکاری مراجع قضائی، نیروهای انتظامی، نیروی مقاومت بسیج سپاه پاسداران انقلاب اسلامی در اجراء طرح های مختلف و پیگیری اجراء آنان به وسیله مدیریت های مربوطه.
4- بررسی گزارش پیشرفت طرح ها و برنامه های اجرا شده توسط کمیسیون های تابعه و ارسال آنها به معاونت سازمانهای اجرایی ستاد.
5- تهیه گزارش عملکرد مدیریت مربوطه جهت ارائه به معاونت سازمانهای اجرایی.

تبصره: مدیریت ها به تناسب موضوعات اقدام به تشکیل کمیسیون یا گروه های کاری مختلف به صورت مقطعی می نمایند.

وظایف دفتر معاونت:
1- تنظیم برنامه ملاقات ها و تشکیل جلسات معاونت مربوطه
2- انجام امور اداری، پشتیبانی، دفتری،مالی از طریق مبادی ذیربط.
3- پیگیری دستور العمل ها، بخشنامه ها، ابلاغیه هاو مکاتبات و ... .
4- تهیه و تنظیم گزارش ماهانه جهت ارسال به معاونت.